鳎亚目鱼类系统学关系及带纹条鳎线粒体DNA控制区结构的初步研究
鲽形目(Pleuronectiformes)鳎亚目(Soleoidei)鱼类包括鳎科(Soleidae)和舌鳎科(Cynoglossidae)，鳎科包含31属120种，舌鳎科包含3属127种。已有学者通过分析16SrRNA、12SrRNA基因和细胞色素B(cyt-b)基因对鳎科一些属间种间的系统学关系进行研究。迄今，未见利用分子生物学手段研究舌鳎科系统学关系的报道。
本文对7种鳎亚目(Soleoidei)鱼类线粒体16SrRNA基因片段和COI基因片段进行了序列比较和分子系统学分析。PCR扩增和测序得到长度为525bp的16SrRNA基因序列和633bp的COI基因序列。7种鳎亚目鱼类线粒体16SrRNA基因片段中共检测到173个变异位点，鳎亚目舌鳎科6种鱼线粒体COI基因片段中共检测到201个变异位点，舌鳎科6种鱼在COI基因序列中变异位点的比例(31.75％)高于16SrRNA基因片段中变异位点的比例(23.05％)，认为COI基因片段与16SrRNA基因片段相比为较灵敏的序列标记。根据16SrRNA基因和COI基因序列变异所得的种间、亚属及属间的平均遗传距离分别是0.0892、0.1739、0.1621和0.1182、0.2223、0.2190，亚属间的平均遗传距离都稍大于属间平均遗传距离，因此，我们认为舌鳎科具有更多属的阶元划分的可能性。另外，根据16SrRNA基因和COI基因序列变异计算所得的紫斑舌鳎与短吻三线舌鳎种间的平均遗传距离分别为0.0021和0.0016，种内的平均遗传距离分别为0.0011和0.0016，种间遗传距离与种内遗传距离相近，所以，两种片段都不能将这两个种分开，但由于他们的形态特征存在细微差别，要断定它们是否为同种异名，还需更多的分类依据。根据16SrRNA基因和COI基因序列变异，利用NJ，UPGMA，ME和MP法所构建的系统树有一共同点：舌鳎属三线舌鳎亚属的4种鱼先与须鳎属的日本须鳎聚类为一枝，然后再与舌鳎属舌鳎亚属的中华舌鳎聚类，这一结果支持舌鳎科具有更多属的阶元划分的可能性的假设。根据线粒体16SrRNA基因和COI基因序列变异研究7种鳎亚目鱼类系统学关系，结果分析表明这两个片段适用于种及种以上阶元的系统学关系的研究，但在一些形态分类中已存在争议的近缘种关系的研究中缺乏说服力，需要寻找更加合适的基因片段作为研究对象。
本文对鳎亚目鳎科条鳎属带纹条鳎(Zebriaszebra)的控制区全序列进行了扩增，并与网上已有鲽形目格陵兰拟庸鲽(Hippoglossoidesreinhardtius)和褐牙鲆(Paralichthysolivaceus)mtDNA控制区全序列进行比较分析，发现3种鱼mtDNA控制区包括三个主要识别区域：扩展终止相关序列、中央保守序列区、保守序列区，在不同的种类间存在大致相同的保守区段：ETAS结构，CSB-D、CSB-F、CSB-E、GTGGG-box结构，CSB-2、CSB-3，其中CSB-D和GTGGG-box结构很保守，而CSB-F、CSB-E、CSB-2、CSB-3种间存在个别碱基的变异，种内未发现变异。Lee等和Guo等已经对一些保守区的功能作过假设，但这些保守区块的作用功能还有待更深入的研究。
鳎亚目;鱼类系统学;RNA基因;COI基因;分子系统学;线粒体DNA;序列结构
中国海洋大学
硕士
水生生物学
孔晓瑜
2005
中文
Q959.486;Q755
68
2006-07-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）