几种双壳贝类ITS区序列分析与遗传多样性研究

陈琳琳

中国海洋大学

摘要：

采用聚合酶链式反应(PCR)对采自日本半岛、俄罗斯海参葳地区以及中国威海等三个自然群体的魁蚶样本的核糖体RNA两个转录间区域(ITS-1和ITS-2)进行了扩增,电泳检测在500bp左右都得到了清晰的扩增产物条带.PCR产物纯化后与T载体连接,进行了克隆、测序.分别得到了长度为421bp和495bp(不含引物)的碱基序列,其中A,C,G,T含量分别为21.85﹪,25.87﹪,27.23﹪,25.04﹪;26.66﹪,22.18﹪,24.04﹪,27.13﹪.ITS2片段序列中的AT含量明显高于ITS1.魁蚶7个个体ITS2片段序列经Gendoc软件排序后检测到两个多态位点,3种单倍型;魁蚶7个个体间的遗传距离为0-0.2﹪.魁蚶16个个体的ITS1片段去除引物排序后检测到了9个多态性核苷酸位点,共7种单倍型;其中发生转换突变的核苷酸位点数为4个,颠换突变位点2个.在三个群体中,通过计算不同个体间的遗传距离构建NJ和MP系统树,16个个体没有明显的聚类现象.ITS1和ITS2片段的在魁蚶中的成功扩增,再次证实两对引物在贝类中通用性良好,而且对小样本量中个体间两个片段的遗传特征的分析比较,为该区域在魁蚶群体遗传多样性研究中的应用提供了基础并展现了良好的应用前景.

关键词：魁蚶(Scapharca broughtonii);巨蛎属牡蛎(Crassostrea oyster);核糖体RNA基因转录间隔区遗传变异;遗传结构;系统学分析;种类鉴定

授予单位：中国海洋大学

授予学位：硕士

学科专业：水产养殖

导师姓名：孔晓瑜

学位年度：2004

语种：中文

分类号：S968.3

页数：88

在线出版日期：2005-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）