栉孔扇贝和海湾扇贝的群体遗传多样性研究及扇贝科几种贝类的分子系统学研究

魏晓华

中国海洋大学

摘要：

该文采用聚合酶链式反应(PCR)技术对栉孔扇贝(Chlamys farreri)大连、青岛、长岛、朝鲜及日本5个自然群体89个个体的核糖体转录间隔子序列(ITS-1)进行了扩增.PCR产物纯化后经T载体连接进行了克隆、测序,排序后得到长度为306bp(不含引物)的序列,A,T,G,C含量分别为33.1﹪、21.3﹪、20.6﹪、25.0﹪,AT含量高于GC含量.MEGA软件检测到44个变异位点,其中有8个插入/缺失突变的的核苷酸位点,36个转换或颠换核苷酸位点,其中3个位点(60、213、215)转换与颠换同时存在,共51种单倍型.5个群体中朝鲜群体拥有的单倍型最丰富,为18个,而且拥有最多的多态性核苷酸位点,长岛群体、日本群体和青岛群体的单倍型数分别为16个、13个和13个,大连群体的单倍型最少,为9个.各群体遗传距离在0.006~0.009之间.在多态位点数S、平均核苷酸差异数K和核苷酸多样性指数Pi三个指标上,朝鲜群体的值相对较高,长岛群体次之,其次为日本群体、青岛群体,大连群体最低.用AMOVA软件计算出群体间差异为2.69﹪,群体内部差异为97.31﹪,表明主要的遗传变异来自于群体内部.利用ITS-1序列构建的UPGMA分子系统树显示各群体没有明显的聚类.结果表明5个群体中以朝鲜群体的遗传多样性最高,其次为长岛群体、日本群体、青岛群体,大连群体最低;不同自然分布区的栉孔扇贝未出现明显的遗传分化.

关键词：分子标记;群体遗传;ITS-1序列;扇贝科;系统演化

授予单位：中国海洋大学

授予学位：硕士

学科专业：水产养殖

导师姓名：孔晓瑜

学位年度：2004

语种：中文

分类号：S968.3

页数：80

在线出版日期：2005-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）