新进腹足目DNA条形码与系统发育研究
新进腹足目是腹足类中种类最为丰富的类群,大约包含了60％的现存腹足类种类。该目贝类大部分生活在海中,具有较高的生态价值和经济价值。但是,针对这一类群的生物多样性及系统发生关系的研究却很少,其分类地位及系统发生关系仍然不明确。随着近年来全球气候变化及环境污染问题的加剧,新进腹足目贝类的生存环境受到了极大的威胁。人类对认识生物多样性、保护生物多样性的需求日益迫切,而物种鉴定是对生物多样性保护和持续利用的基础。DNA条形码技术作为一种快速而准确进行物种鉴定的技术受到人们广泛的关注。在本研究我们首先验证了DNA条形码技术的可行性,然后利用该技术对新进腹足目贝类进行了初步的系统发生关系的研究。具体研究结果如下: 1.对采自中国沿海新进腹足目贝类50种共137个个体的线粒体COI序列进行PCR扩增及测序,共得到其中45种110条COI序列,扩增个体成功率为80.3％。对所得到的COI序列进行分析,发现种内遗传距离在0.00％到3.89％之间,平均为0.44％;属内种间遗传距离在7.01％到26.95％之间,平均为13.96％;科内种间遗传距离在8.23％到31.19％之间,平均为22.27％。可以看出,种间遗传距离远远大于种内的遗传距离,存在条形码间隙。结果证明,基于COI基因的DNA条形码技术可以有效鉴定所研究的种类。 2.测定了新进腹足目26种贝类的16S rRNA基因序列,并从GenBank上下载了部分种类的Col和16S rRNA基因序列,连同上一节研究中得到的COI序列对新进腹足目贝类进行初步的系统发生关系研究。在邻接树及贝叶斯两种系统树上,所有种类均形成单系群,且具有较高的支持度。在基于COI序列构建的系统树中,部分属及总科没有形成单系,其系统树拓扑结构明显比基于16S序列构建的系统树效果要差。在基于16S序列构建的系统树中,六个总科及大部分属都表现出较近的亲缘关系。利用线粒体基因序列构建的系统发生树得出的新进腹足目系统生发关系,与传统的形态分析结果基本一致。
DNA条形码;系统发生;新进腹足目;物种鉴定
中国海洋大学
硕士
水生生物学
李琪
2012
中文
Q959.212;S944.3
71
2012-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）