分子方法研究环境中缘毛类纤毛虫的多样性和分布——以逛荡河为例

刘西汉

中国海洋大学

摘要：

缘毛类纤毛虫是一类多样性极高且具有复杂生活史的原生动物，在周丛生态系统、水质监测和水产养殖方面具有重要的意义。迄今为止，关于缘毛类纤毛虫群落组成的调查均是以形态特征为基础，通过活体观察和银染等方法实现的。本研究利用分子生态学的方法对环境中(逛荡河)缘毛类纤毛虫的多样性和丰度做了调查。
作者针对于核糖体小亚基基因(SSU rDNA)，设计出4组缘毛类特异性的引物，对环境样品进行了克隆文库构建和定量PCR分析。逛荡河4个采样地点的水样具有明显的盐度梯度，克隆文库结果显示缘毛类群落组成随盐度变化而有显著差异，多样性随着盐度的升高而降低。定量PCR分析以rDNA拷贝数为标准，也显示出缘毛类rDNA丰度和盐度的相关性。
本工作是首次将分子生态学的方法应用于缘毛类纤毛虫的多样性和丰度研究，提供了一套克隆文库和定量PCR的研究策略。在其他生境(如富营养水体、养殖水体、生物膜等)中，研究者可以利用本工作提供的方法对此类纤毛虫进行研究。此外，本次工作的成功还表明分子生态学的方法对其他类群纤毛虫可能也具有相同的适用性。

关键词：缘毛类纤毛虫;定量PCR;特异性引物;SSUrDNA拷贝数;分子生态学;生物多样性

授予单位：中国海洋大学

授予学位：硕士

学科专业：生物工程

导师姓名：许恒龙;龚骏

学位年度：2012

语种：中文

分类号：Q959.117

页数：57

在线出版日期：2012-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）