虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)遗传连锁图谱的构建
虾夷扇贝(Patinopectenyessoensis)为冷水性贝类，原分布于日本北部、库页岛、千岛群岛以及朝鲜地区。因其闭壳肌肥大，味道鲜美，在北美、欧洲和亚洲市场深受欢迎。中国于20世纪80年代初进行引种，目前已经在山东、辽宁等北部沿海形成规模化和产业化养殖，成为我国一种重要的经济养殖贝类。自1998年开始，有关增加虾夷扇贝产量的课题纷纷开展，由于经过连续多代的人工养殖，虾夷扇贝养殖群体内已经出现一定的近交现象，新品种的选育是解决这个问题的有效手段。随着分子标记辅助育种体系的不断发展和完善，其在基础群体的构建、选育群体遗传多样性的维系和重要经济性状的遗传学解析等方面将会发挥越来越重要的作用。本研究分两大部分，第一部分是对虾夷扇贝进行微卫星DNA标记的筛选，第二部分是构建虾夷扇贝的遗传连锁图谱，以期为虾夷扇贝的分子辅助选育提供基础信息参考。
一：虾夷扇贝微卫星标记的开发
本实验利用富集文库．菌落原位杂交法构建了虾夷扇贝的微卫星DNA富集文库，挑选300个克隆进行阳性扫描，发现231个阳性克隆，阳性克隆率为72.1％。挑选50个阳性克隆进行测序，其中45个含有微卫星序列，微卫星DNA片段率为90％。其中20个可以设计引物进行扩增，占所有含有微卫星DNA片段的比例为44％。从中筛选了8个虾夷扇贝微卫星标记，利用48个虾夷扇贝个体对这8个位点进行了多态性评价，得到7个具有多态性的微卫星位点，结果显示扩增得到的等位基因数目从2到7个不等，观测杂合度范围从0.6316到1.0000，期望杂合度范围从0.4321到0.8403。实验证明，富集文库-菌落原位杂交法的筛选效率高，是一种很好的筛选微卫星DNA标记的方法。
二：虾夷扇贝遗传连锁图谱的构建
为了加强虾夷扇贝选育工作的有效性和准确性，真正在虾夷扇贝中实现分子标记辅助选育，本文利用AFLP和微卫星DNA标记在1个全同胞F1代家系中分别构建了虾夷扇贝的雄性和雌性遗传连锁图谱。最后的雄性连锁图谱由180个遗传标记组成，分布于21个连锁群。其中AFLP标记176个，微卫星DNA标记4个，图谱总长度为1237.33 cM，标记平均间隔为7.78 cM。雌性连锁图谱共有134个遗传标记，共有25个连锁群。AFLP标记132个，微卫星DNA标记2个，图谱总长度为794.06 cM，标记平均间隔为7.29 cM。经计算雄性连锁图谱的预期长度为1537.06 cM，覆盖率为80.51％。雌性连锁图谱的预期长度为1102.38cM，覆盖率为72.03％。在本实验中，得到的雄性图谱和雌性图谱的连锁群长度均不是很长，雄性连锁群总长度比雌性连锁群长度长了很多，所以，雌雄图谱显示了不小的差异，可能由雄性父本基因组的高杂合度造成。
虾夷扇贝;标记辅助育种;微卫星DNA;富集文库;遗传连锁图谱
中国海洋大学
硕士
遗传学
包振民;胡景杰
2009
中文
S968.3;S917.4
63
2009-10-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）