主要饵料微藻的分子系统学分析
本文选取收集在中国海洋大学藻种库中绿藻门的三个属(杜氏藻属、四爿藻属、小球藻属)、金藻门的两个属(等鞭藻属、巴夫藻属)、硅藻门的三个属(菱形藻属、褐指藻属、角刺藻属)的一些未明确其确切种类的饵料微藻，扩增并测定其核糖体18SrRNA序列以及部分藻株的核糖体5.8S rRNA和ITS序列，同时从基因库搜索相关微藻的基因序列，对这些微藻的系统发生关系进行了分析，以为这些藻株的分类鉴定提供分子依据。
扩增的绿藻门3个属的18SrRNA序列长度在1671-1729bp之间，分析结果如下：(1)杜氏盐藻属26株盐藻18SrRNA序列的GC含量最低为48.4％，最高为49.0％，在比对的1638个位点中，保守位点1531个，转换和颠换位点92个，插入或缺失位点15个，转换和颠换位点变异率为5.6％，插入或缺失位点变异率为0.9％。系统分析结果表明，26株盐藻可分为三大支，其中D.salina，D.bardawil，D.tertiolecta，D.bioculata，D.primolecta，D.parva共同聚类成一支，D.viridis和D.lateralis strain Nepal分别聚为一支。这与利用ITS1和ITS2进行分析的结果相似。根据序列多样性，7株未明确盐藻中，A43、A57、A83、A85和C43均与D.viridis亲缘关系最近，可以确定为D.viridis的不同株系。而根据18S rRNA序列分析，A121和A124聚类位置处于D.salina和D.viridis之间，根据ITSs序列，两者则与D.viridis更为接近。(2)四爿藻属19株18SrRNA序列GC含量最低为46.8％，最高为47.7％，在比对的1628个位点中，保守位点1551个，转换和颠换位点66个，插入或缺失位点11个，转换和颠换位点变异率为4.1％，插入或缺失位点变异率为0.7％。系统分析表明，四爿藻属19个序列可以分为四个分支，其中C75与T.striata的亲缘关系最近，C73、C74、C152与T.suecica strainKMMCC P-9和T.subcordiformis之间的亲缘关系最近，而C151可能属于T。helgolandica var.tsingtaoensis的一个株系。(3)小球藻属18SrRNA序列的GC含量最高接近50％，在比对的1756个位点中，保守位点1707个，转换和颠换位点49个，无插入或缺失位点，转换和颠换位点变异率为2.8％。种质库的CF126与C.sorokiniana亲缘关系最近。
金藻门两个属的分析结果如下：(1)在比对的23株巴夫藻的18S rRNA序列1714个位点中保守位点1464个，插入或缺失位点70个，多态位点180个，其中简约信息位点147个。构建进化树结果表明，23个巴夫藻相应序列可分为4个大支，8个p.pinguis株系与1个p.pseudogranifera株系优先聚为一支，5个p.gyrans聚为一支，3个Pa.salina株系单独聚类成一支，来自种质库的藻株BF和p.viridis优先相聚又依次与p.virecens和p.lutheri相聚，结果表明，BF可能就是p.viridis的一个株系。(2)7株等鞭金藻的18S rRNA部分序列的比对结果表明，在比对的1399个位点中，保守位点1341个，插入或缺失位点13个，多态位点45个，其中简约信息位点2个。亲缘关系分析结果表明来自种质库的3011、8701与球等鞭金藻(I.galbana)有非常近的亲缘关系，S18、S29与I.aff。galbana'Tahitian isolate’亲缘关系最近。
PCR扩增种质库的4株硅藻18SrRNA序列长度为1687-1726bp之间，与基因库已有的相关22条序列信息进行比较，亲缘关系分析结果表明，根据18S rRNA可将分属于菱形藻属、褐指藻属和角毛藻属的硅藻完全分开，其中来自种质库的B228和B253与三角褐指藻(p.triconutum)完全聚为一支，说明两者均为三角褐指藻的不同株系，而B13则与角毛藻属的微藻种C.gracilis完全聚类。本研究的结果还表明，小新月菱形藻完全与三角褐指藻聚为一支，而并未与菱形藻属的新月菱形藻聚类，显示该微藻可能与三角褐指藻的亲缘更近。
微藻;基因序列;系统发生;5.8S rRNA;分类鉴定;PCR扩增种质库
中国海洋大学
硕士
水生生物学
李赟
2009
中文
Q949.2;Q522.6
45
2009-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）