海带遗传图谱构建与QTL定位研究
海带是一种非常重要的大型经济海藻，是产量和规模最大的一种水生植物，且用途非常广。目前，海带分子数量遗传学研究才刚刚起步，已构建的遗传连锁图谱和定位出的QTL还远远不能够满足育种需求。已报道的海带遗传图谱主要由AFLP这种显性标记构成，SSR共显性标记使用量很少（目前共计18个），造成这些图谱适用范围较小。另一方面，海带QTL定位研究中仅对叶片长度和宽度两个数量性状有研究，而且只定位出5个QTL（与长度相关的3个QTL和与宽度相关的2个QTL），这对于探索海带数量遗传学还远远不足。 本研究以表型性状相差较大的长叶海带（Saccharina longissima）和海带（Saccharina japonica）为亲本构建了F2分离群，随机选取102棵藻体完整的孢子体作为作图群体，同时利用AFLP、SRAP和SSR三种标记技术，利用JionMap和MapMaker两种作图方法构建海带遗传连锁图谱。研究了海带叶片长度、宽度、中带宽、厚度、鲜重和基部形态六个数量性状，并进行CIM和IM多种方法的综合QTL定位分析。研究结果概括如下：（1）本研究共统计到632个多态性位点，其中包括221个AFLP位点、133个SRAP位点和278个SSR位点。（2）在所统计到的632个位点中，210个位点表现为偏分离（P<0.05），所占比例为33.23％。显性标记的偏分离比例（45.20%）比共显性标记（17.98%）的高。（3）利用去除偏分离位点后的422个位点（137个AFLP位点、57个SRAP位点和228个SSR位点）构建了海带的遗传连锁图谱。该图谱锚定有327个位点，包含有45个连锁群，覆盖总图距为2233.1 cM。连锁群大小范围为0.9~175.3 cM，平均两个标记间的图距为7.92 cM。（5）本研究共定位出29个QTL，性状贡献率达到1.06%~64.00%。其中与长度相关的QTL有3个，性状贡献率为2.93%~20.17%；与宽度相关的QTL有5个，性状贡献率为15.56%~44.91%；与中带宽相关的QTL有2个，性状贡献率为28.18%~64.00%；与厚度相关的QTL有2个，性状贡献率为13.63%~16.95%；与鲜重相关的QTL有3个，性状贡献率为3.01%~24.53%；与基部形态相关的QTL有14个，性状贡献率为1.06%~10.11%。 本研究构建的遗传连锁图谱与定位出的QTL能够为今后海带分子数量遗传学的研究奠定一定的基础。将这些技术方法应用在育种过程中，可以提高对优良基因型选择的预见性和准确性，加速育种进程。还可以为海带MAS育种、分子聚合育种、主效QTL的图位克隆等研究奠定基础，为海带良种的选择与培育提供新的策略与方法。
海带;遗传图谱;QTL定位;标记技术
中国海洋大学
硕士
海洋生物学
刘涛
2013
中文
Q949.288.4;Q943.2
108
2013-09-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）